На территории Сергиевского района немало естественных и искусственных водоёмов. К ним относятся большие и малые реки, родники, озёра, пруды и водохранилища.
Река Сок - одна из крупных рек Самарской области. Её длина около 375 км,общая площадь водосбора - 11870 кв. км. Своё начало Сок берёт в отрогах Южного Урала.

Долина реки развитая, ширина от 1,6 до 10 км. Пойма широкая, покрыта луговой и древесно-кустарниковой растительностью, богата многочисленными озерами и старицами. Нижний участок поймы в настоящее время частично затеплен водами Саратовского водохранилища и представляет собой обширный залив со слабым течением.
В реку Сок впадает 91 приток, из которых, на территории Самарской области, протекает 85. Главным притоком является река Кондурча, впадающая в него справа близ села Красный Яр. Длина Кондурчи 324 км, площадь водосбора 4380 кв. км.
Характерной особенностью Сока является повышенная минерализация воды в летнее время, когда река в своем верхнем и среднем течениях сильно мелеет и питается за счет ключей, вода которых содержит большое количество сернистых соединений. Они обуславливают особый цвет и вкус воды.
Русла рек во многих местах перепружены многочисленными плотинами и в летнее время представляют собой цепочку прудов.
Среди местных водоёмов немало уникальных, являющихся ценными памятниками природы. Наибольший научный и практический интерес представляют озёра Серное, Голубое, сероводородные источники и некоторые другие.
Озеро Серное расположено на территории Сергиевские Минеральные Воды.Площадь водного зеркала составляет около гектара, а глубина не превышает трёх метров. Водоём питается источниками, дающими в сутки 6 миллионов литров воды. Лечебные свойства воды озера и источников были впервые отмечены ещё И. И. Лепёхиным и П. С. Палласом. Вода из Серного озера вытекает в виде реки Молочной, которая впадает в реку Сургут.

Серное озеро с вливающимися в него минеральными и пресными источниками - самое живописное место. В парке санатория "Сергиевские минеральные воды" находится столетний клен. Красота пейзажа, шум падающей кристально чистой воды на плотике и у родников, бирюзовое, черное, синевато-голубое, изумрудное зеркало воды вызывает восхищение.
Жизнь озера совершенно необычайна: над ним не кружат птицы, на его поверхность не садятся утки, на нем не растут кувшинки, как на обычных водоёмах, нет насекомых и рыб - условия жизни для них не подходящие - слишком велико содержание сероводорода.
В любое время года оно неповторимо и восхищает красотой пейзажа.

Еще одним уникальным озером Сергиевского района является Голубое озеро. Оно находится на территорииСергиевского района близ села Старое Якушкино. Площадь озера около 300 кв. метров. Оно представляет собой карстовую воронку глубиной до 23 метров, наполненную до краев изумрудно-голубой прозрачной водой с запахом сероводорода. Оно необычайно красиво.